Die Allgemeine Poliklinik wurde im Jahr 1872 von zwölf Universitätsassistenten gegründet. Neu am Konzept der Wiener Poliklinik war, dass man bemüht war, die gesamte Palette medizinischer Fächer abzudecken, was europaweit eine Premiere war.

Nach Stationen in der Wipplingerstraße, in der Oppolzergasse und der Schwarzspaniergasse wurde schließlich 1892 die Mariannengasse in 1090 Wien bezogen. Die Ambulanzen der Klinik sollten insbesondere die Versorgung sozial schwacher Patient:innen verbessern und andererseits auch die Lehr- und Forschungstätigkeit erleichtern. Bereits im ersten Jahr wurden rund 12.000 Patient:innen kostenlos behandelt. Die Kosten wurden dabei anfangs von den Gründern getragen, später wurde ein Verein zur Finanzierung ins Leben gerufen, der u. a. von der Fürstin Pauline von Metternich unterstützt wurde.

Viktor Frankl, der von 1933 bis 1937 im Psychiatrischen Krankenhaus Rosenhügel den sogenannten „Selbstmörder:innenpavillon“ geleitet hat, wurde 1946 zum  Vorstand der neurologischen Abteilung der Poliklinik berufen, ein Posten, den er bis 1971 bekleidete. Ab 1955 hatte er darüber hinaus eine Professur für Neurologie und Psychiatrie an der Universität Wien inne.

Unter den Gründern war auch der Internist und Laryngologe Johann Schnitzler, dessen Sohn Arthur bis 1893 als sein Assistent tätig war. Mit seinem Professor Bernhardi setzte Arthur Schnitzler der Poliklinik ein literarisches Denkmal.

Die Poliklinik wurde am 15. Dezember 1998 endgültig geschlossen. Die Sanierung des denkmalgeschützten Haupthauses in der Mariannengasse 10 begann 2008, vier Jahre später wurde schließlich das Vienna Policenter eröffnet.